半小时!“高新造”测序平台让四川省首例猴痘病毒完成快速鉴定与分析

2024-11-09 20:35:14 

研究结果在核心期刊上《疾病监测》发布

 

近日,四川省疾病预防控制中心微生物检验所(以下简称“检验所”)在核心期刊《疾病监测》发表了四川省首例猴痘确诊病例全基因组特征分析的研究结果,全基因组测序基于齐碳科技自主研发的纳米孔测序平台完成。


2023年,四川省报告了首例猴痘确诊病例,检验所基于齐碳纳米孔测序平台在短短半小时内便完成型别鉴定。


猴痘是由猴痘病毒(MPXV)引起的人畜共患传染病,主要表现为发热、剧烈头痛、淋巴结肿大、皮疹等。2022年暴发的猴痘疫情已蔓延至全球123个国家和地区,截止至2024年9月,实验室确认的感染病例累计已超10.9万例,导致236人死亡。世界卫生组织先后在2022年和2024年,两度就猴痘疫情发布最高级别预警,宣布其构成“国际关注的突发公共卫生事件”(PHEIC)。


纳米孔单病原基因组靶向测序解决方案


国家卫健委、国家中医药管理局联合发布了《猴痘诊疗指南(2022年版)》(后简称《指南》)。《指南》指出,我国猴痘防治工作应以入境人员和进口动物的检疫为重点,并将猴痘诊断类型分为疑似病例和确诊病例,诊断依据结合流行病史、临床表现和病原学检查,对于可疑病例,建议通过快速诊断检测早发现、早诊断,以避免病毒在社区传播。


分子诊断是目前公认的重要诊断手段,其中,核酸扩增和血清学检测能以低成本快速诊断猴痘病例,但这些检测不能用于监测MPXV的来源、谱系、传播和基因组变异。新出现的变异株可能会使得样本中的病毒载量被低估,甚至导致误诊。为了更好地开展MPXV感染的预防和治疗,有必要制定具有成本效益和高质量的基因组测序策略。


纳米孔基因测序作为最新一代商用的测序技术,齐碳基于自主研发的纳米孔测序平台推出的亓原(QPathNano)单病原基因组靶向测序解决方案,涵盖诸如新冠病毒、猴痘病毒、HIV病毒、流感病毒、诺如病毒、登革病毒等17种病原体,发挥长读长、实时测序、操作精简、小巧便携的优势,为公共卫生与防疫应用和科学研究提供了更加全面、便捷、高效的纳米孔测序工具,助力公共卫生体系构建常态化防控与应急响应机制,强化疫情监测与预警能力,实现重大/新发传染病爆发流行的早发现、早处置,为公共卫生安全保驾护航。


文字:袁也然

图片由齐碳科技提供

编辑:李艺萱


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